בעלי גולגולת (שם מדעי: Craniata, לפעמים Craniota) היא תת⁻מערכה של מיתרניים המתאפיינים, כמשמעות השם, בקיום גולגולת של עצם או סחוס. תת⁻מערכת זו כוללת: מתוך ויקיפדיה

בעלי אף⁻לח, בעלי ארבע גפיים, בעלי ארבע רגליים, בעלי ביב, בעלי ברית (סרט), בעלי גלגול חסר, בעלי גלגול מלא, בעלי גלגול⁻למחצה, בעלי דין, בעלי דם חם